战舰装备是军团海战体系的核心组成部分，主要分为驱逐舰、巡洋舰、战列舰和航空母舰四大类。驱逐舰作为基础舰种，具备较高的机动性和反潜能力，适合执行护航与侦察任务；巡洋舰在火力与防护上较为均衡，可承担舰队防空及中程火力支援；战列舰以重型火炮为主要武器，拥有最强大的对舰打击能力但机动性较差；航空母舰则通过舰载机实现远程打击，是舰队战略投送的关键力量。这些舰船需通过船坞建造，消耗金币、石材、石油等资源，制造时间从数分钟到数小时不等，可通过道具或钻石加速。
战舰装备的性能提升依赖升级与改装系统。升级可提高基础属性如射程、火力和防御，改装则提供定向强化选项，例如增加装甲厚度或提升航行速度。驱逐舰建议优先升级鱼雷发射管与声呐设备，巡洋舰需强化防空炮与主炮精度，战列舰重点提升主炮威力和装甲带，航空母舰则需优化舰载机容量与起飞效率。舰船改造材料需通过战役奖励或商业区交易获取，高阶改装图纸通常来自特定战场成就。
海军装备的战术运用需结合战场环境。在近海作战中，驱逐舰与潜艇配合可实施隐蔽突袭；远洋舰队应以战列舰为核心，搭配巡洋舰组成防空火力网；航空母舰编队需保持与敌舰距离，依靠舰载机进行超视距打击。所有舰船均受补给系统制约，燃料与弹药储备直接影响持续作战能力，因此需在军团城市建立完善的军需供应链。
军团战舰的特殊装备通过联赛与赛季活动获取。潜水艇具备雷达隐身特性，适合伏击运输线；海军航空兵可装备反舰火箭弹与深水炸弹；部分传奇舰船如衣阿华级战列舰、企业号航母等拥有专属技能，需完成历史战役任务解锁。这些高级装备的研发需要军团成员协同贡献资源，在军需部统一分配制造权限。
战舰装备的后期发展聚焦于科技树与兵种联动。橙色科技贼鸥俯冲轰炸机可增强航母对地攻击效率，红色战场策略狼群战术能提升潜艇编队伤害。海军与陆军的协同尤为关键，例如火箭炮部队可为海岸作战提供火力支援，而陆军占领的港口直接影响舰队维修效率。合理的科技投资与跨兵种配合是取得制海权的决定性因素。
